第3章　呼吸道微生物群与微生物组特征

随着广范围PCR（broad range PCR）技术和新一代焦磷酸测序（pyrosequencing）技术的不断完善，以此为基础的人体微生物组研究得到了广泛的开展，也获得了诸多的研究成果。但是，与消化道、泌尿生殖道的微生物组研究相比，呼吸道的微生物组研究始终处在一个相对滞后的状态，主要出于以下几个原因：第一，经典理论认为，由于呼吸道的解剖学和组织学特点，下呼吸道几乎处于无菌的状态，因此对于健康人下呼吸道的微生物组研究一直处于被忽视的状态。第二，正常呼吸道相对于消化道和泌尿道而言，有形的排出物非常稀少，正常人很难在自然条件下排出具有研究价值的排泄物。第三，由于下呼吸道的排出物在自然条件下获取容易受到口腔的污染，如果需要得到能客观忠实地反映下呼吸道生境（habitat）的标本，就需要借助一些诸如支气管肺泡灌洗（bronchoalveolar lavage）和支气管肺泡毛刷（bronchoalveolar brush）等有创的介入手段，在健康人群中开展有创的标本采集容易遭到被检者的抵触，同时也会引起一系列医学研究的伦理问题。因此，有创性的标本采集方法也是阻碍呼吸道微生物组研究发展的一个主要因素。

但是随着研究的不断深入，呼吸道微生物组的研究也有了长足的发展，本章的主要目的就是介绍人体呼吸道，特别是下呼吸道微生物组研究的进展和最新发现。